La Escuela Comunitaria San Antonio de Los Altos nació el día 7 de enero del año 1959 bajo la dirección de su fundadora Sara Guardia de Mendoza, en sus inicios únicamente contaba con una profesora y ocho alumnos hijos de los que apoyaron en la creación de esta escuela.

Su primera sede fue una pequeña casa cerca del Cementerio de San Antonio, posteriormente en el año 1960 mudaron la escuela a la Quinta La Chata situada en la Redoma de Rosalito, más tarde, en el año 1964 se mudan a la Quinta Alita, en la misma zona que la anterior.

En el año 1966 se crea una Asociación Civil de esta escuela conformada por los padres fundadores. Para el año 1967 logran pagar una inicial para comprar la Quinta donde se encontraba funcionando la escuela y comienzan a adaptar los espacios.

Desde el año 1966 ya se dictaba educación preescolar en las mañanas y educación básica todo el día, hasta que en el año 1984 se abre el bachillerato, para ese momento la escuela se situaba en un Quinta de la Urbanización la Suiza.